Puzzle Box acompanha o viciado em drogas em recuperação Kait, que foge para uma casa na floresta para se reabilitar. Junto com sua irmã Olivia, que decide documentar o processo, coisas estranhas começam a acontecer quando o layout da casa começa a mudar misteriosamente, e eles ficam presos na caixa de quebra-cabeça inescapável e de pesadelo da casa.